№ 1 «Гармония», на востоке Москвы (вошла в ВЛР при учреждении)
№2/10 «Объединенные Ложи Лотос и Братская любовь», на востоке Москвы («Лотос» №2 вошла в ВЛР при учреждении, «Братская любовь» №10 создана 6 марта 1999 г. как «путешествующая»)
№ 3 “Астрея”, на востоке Санкт-Петербурга
№ 4 «Гамаюн», на востоке Воронежа (вошла в ВЛР при учреждении)
№ 5 «Аврора», на востоке Москвы (англоязычная ложа, создана 23 июня 1996 г.)
№ 6 “Полярная звезда”, на востоке Москвы
№ 7 «Юпитер», на востоке Москвы (создана 19 ноября 1997 г.)
№ 8 «Четверо Коронованных», на востоке Москвы (исследовательская ложа, создана 12 июня 1998 г.)
№ 9 «Северное Сияние», на востоке Москвы (создана 28 ноября 1998 г.)
№ 11 «Александр Сергеевич Пушкин», на востоке Москвы (создана 12 июня 1999 г.)
№12 “Тихоокеанское побережье”, на востоке Владивостока (создана в октябре 2000 года, работы приостановлены)
№ 13 — не учреждалась
№ 14 “Фёдор Волков”, на востоке Ярославля (создана в январе 2001 года, работы приостановлены)
№ 15 «Орион», на востоке Москвы (создана под эгидой ВЛР 8 февраля 2001 г.)
№ 16 «Феникс», на востоке Москвы (создана 1 марта 2001 г.)
№17 “Изида и Озирис”, на востоке Москвы (создана 26 марта 2001 года, работы приостановлены)
№ 19 “Северные братья”, на востоке Мурманска (создана 23 февраля 2002 года, работы приостановлены)
№ 20 “Доблесть”, на востоке Москвы (создана Великой Ложей Молдовы, перешла под юрисдикцию ВЛР 15 июня 2002 года, работы приостановлены)
№ 21 “Созвездие”, на востоке Москвы (создана Великой Ложей Молдовы, перешла под юрисдикцию ВЛР 15 июня 2002 года, работы приостановлены)
№ 22 “Под тремя коронами”, на востоке Калининграда (создана 30 июня 2002 года, работы приостановлены)
№ 23 “Альфа и Омега”, на Востоке Минска (создана в Новосибирске 12 июля 2002 года, работы приостановлены в октябре 2010 года, возобновлены в Минске 3 сентября 2016 года)
№ 25 “Белый Рыцарь”, на востоке Минска (пробуждена в Москве 12 сентября 2015 года)
№ 26 “Треугольник Хирама”, на востоке Москвы (создана 4 июня 2004 года для совместных работ российских, итальянских и американских братьев, работы приостановлены)
№ 27 «Цитадель», на востоке Москвы (создана 27 мая 2006 г.)
№ 28 “Святой грааль”, на востоке Воронежа (создана 5 января 2007 года для работ по обряду Циннендорфа, работы приостановлены)
№ 29 «Акация», на востоке Сочи (создана 18 апреля 2008 г.)
№ 30 «Форпост», на востоке Магнитогорска (создана 17 мая 2008 г., работы приостановлены)
№ 31 «Каменный пояс», на востоке Екатеринбурга (создана 6 июня 2009 г.)
№ 32 «Франция» на востоке Москвы (создана 29 октября 2009 г., работы проводятся по Французскому уставу)
№ 33 «Муз», на востоке Санкт-Петербурга (создана в 1770 году Иваном Перфильевичем Елагиным. В 1772 году им выписан соответствующий патент. Возобновление работ проведено 6 марта 2010 г. в Санкт-Петербурге)
№34 «Совершенное согласие», на востоке Москвы (франкофонная ложа, работает по Французскому уставу. Инсталляция проведена 27 ноября 2010 г в Санкт-Петербурге)
№ 35 «Дельта», на востоке Краснодара (создана 6 марта 2011 г.)
№ 36 «Федор Ушаков», на востоке Саранска (создана 12 марта 2011 г.)
№37 «Клио», на востоке Москвы (создана в 1774 году. Возобновление работ проведено 9 апреля 2011 г., путешествующая)
№ 38 «Два Орла», на востоке Минска (создана в 1770 году. Возобновление работ проведено 16 декабря 2012 г. в Минске, белорусская ложа)
№ 40 «Леон Великий», на востоке Сухуми (абхазская ложа, учреждена в январе 2013 года)
№ 42 «Арарагат», на востоке Москвы (создана 5 июля 2013 г., работы проводятся по ритуалам Эмулейшн)
№ 43 «Павел Павлович Демидов», на востоке Екатеринбурга (создана 27 сентября 2013 г., работает по Древнему и принятому Шотландскому обряду)
№ 44 «Золотой ключ», на востоке Перми (основана 24 июня 1783 года, воссоздана 29 сентября 2013 г.)
№ 45 «А. С. Грибоедов», на востоке Санкт-Петербурга (создана 22 апреля 2014 г.)
№ 46 «Череп и Крест», на востоке Нижнего Новгорода (создана 27 сентября 2014 г.)
№ 47 «Братская цепь», на востоке Челябинска (создана 25 октября 2014 г. в Екатеринбурге). С 24 апреля 2021 года восстановлена в городе Курск.
№ 49 «Джузеппе Гарибальди», на востоке Москвы (создана 8 мая 2015 г., работы будут проходить по Восточному обряду)
№ 50 «Шипка», на востоке Москвы (создана 28 февраля 2015 года для работы на болгарском языке)
№ 53 “Конкордия”, на востоке города Шахты Ростовской области (создана 11 июня 2016 года)
№ 54 “Восходящего Солнца”, на востоке Казани (основана в 1176 году, воссоздана 8 октября 2016 года)
№56 “Нур” (Бишкек, Киргизия) (Создана 8 декабря 2018 года)
№57 “Прометей” , на востоке Великого Новгорода (создана 11 мая 2019 года)
№58 “Джанкарло Сери”, на востоке Самары (создана 14 сентября 2019 года, работает по Восточному обряду)
№59 “Ренессанс”, на востоке Москвы (работает по обряду Эмулейшн)
№60 “Гиперион”, на востоке Анапы (создана 1 августа 2020 года, работает по обряду Эмулейшн)
№61 “Свет Сибири” на востоке Новосибирска (создана 27 марта 2021 года, работает по Древнему и принятому Шотландскому обряду)
№62 “Антарес” на востоке Тюмени (создана 7 мая 2021 года, работает по обряду Эмулейшн)
Ложи перешедшие к другим великим ложам при их образовании
№ 18 «Сер» (создана 4 декабря 2001 г. Передана под юрисдикцию Великой ложи Армении 30 июля 2002 г.);
№ 24 «Дружба» (основана в Москве 3 июля 2003 г., как путешествующая ложа для азербайджанцев. 8 декабря 2008 вошла в состав Великой национальной ложи Азербайджана при её образовании)
№39 «Святой Давид — Строитель», на востоке Москвы (грузинская ложа, 14 марта 2015 года перешла под юрисдикцию Великой Ложи Грузии)
№41 «Святая Тамара», на востоке Тбилиси (грузинская ложа, 14 марта 2015 года перешла под юрисдикцию Великой Ложи Грузии)
№ 48 «Георгий V Блистательный», на востоке Тбилиси (грузинская ложа, создана 14 марта 2015 года, 14 марта 2015 года перешла под юрисдикцию Великой Ложи Грузии)
№51 “Алихан Бокейханов”, на востоке Алма-Аты (создана 12 ноября 2016 года, перешла под юрисдикцию Великой Ложи Казахстана при ее создании)
№ 52 “Свет Востока”, на востоке Алма-Аты (создана 14 мая 2016 года, перешла под юрисдикцию Великой Ложи Казахстана при ее создании)
№ 55 “United Nomadic Brothers”, на востоке Алма-Аты (создана 17 сентября 2016 года, перешла под юрисдикцию Великой Ложи Казахстана при ее создании)